135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1536 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 331 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  59.01 
 
 		 173 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  46.43 
 
 		 174 aa  154  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 171 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0527  GCN5-related N-acetyltransferase  49.61 
 
 		 135 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.713805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3715  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 		 156 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  35.93 
 
 		 177 aa  99  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  33.79 
 
 		 163 aa  68.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  27.33 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.43 
 
 		 181 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.43 
 
 		 181 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.43 
 
 		 181 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.43 
 
 		 181 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 178 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  37.27 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.81 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  30.49 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  28.3 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  31.65 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  37.27 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  36.36 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  36.36 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  36.73 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1968  mutT/nudix family protein  35.45 
 
 		 202 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.31 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  28.06 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  30.38 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  30.66 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 185 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  26.85 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.89 
 
 		 459 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  33.04 
 
 		 451 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 181 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.88 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.88 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.88 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.94 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1831  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 202 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000890359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.88 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.88 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.88 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.41 
 
 		 174 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  34.88 
 
 		 166 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3569  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.16 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.863637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.17 
 
 		 213 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  28.48 
 
 		 180 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  34.75 
 
 		 118 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0774  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  29.37 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.88 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.06 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.32 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.49 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 182 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.68 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.48 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  31.82 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.82 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  23.29 
 
 		 193 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.34 
 
 		 179 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 181 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  24.84 
 
 		 185 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4188  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.33 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.03 
 
 		 181 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5294  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.42 
 
 		 190 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.06 
 
 		 181 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2726  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  26.47 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 169 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.72 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1568  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  25.53 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.331903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  26.39 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  35.29 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.63 
 
 		 175 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.67 
 
 		 186 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.62 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 		 149 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  22.01 
 
 		 180 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  31.68 
 
 		 184 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  32.73 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12740  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.02 
 
 		 196 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251434  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.65 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>