More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1529 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  909    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  30.37 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  33.9 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 427 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.88 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 424 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.84 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.52 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.72 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  29.24 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.43 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.06 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  29.45 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 419 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  29.26 
 
 		 420 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 418 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.35 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.39 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.04 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.11 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.14 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.14 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.45 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.52 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.13 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  25.68 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  21.54 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>