40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1509 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  49.19 
 
 
184 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.64 
 
 
187 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.79 
 
 
182 aa  112  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.03 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.07 
 
 
185 aa  84  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  36.31 
 
 
188 aa  83.2  2e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.77 
 
 
187 aa  82.4  4e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55045e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.77 
 
 
183 aa  79.3  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.81 
 
 
182 aa  77.4  1e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  32.95 
 
 
188 aa  76.6  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.79 
 
 
202 aa  69.3  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.79 
 
 
202 aa  67.4  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.57 
 
 
202 aa  67  2e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  26.15 
 
 
201 aa  66.6  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  27.03 
 
 
183 aa  66.2  3e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  26.49 
 
 
184 aa  64.7  8e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.13 
 
 
182 aa  63.9  1e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.51 
 
 
184 aa  62  5e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.62 
 
 
184 aa  62  5e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 
177 aa  61.6  7e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.91976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  28.67 
 
 
177 aa  60.8  1e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.49 
 
 
179 aa  55.5  4e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  23.23 
 
 
437 aa  54.3  9e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  6.3148e-08 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.97 
 
 
185 aa  53.5  2e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  29.25 
 
 
185 aa  52.4  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.05 
 
 
178 aa  52.4  4e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  25.32 
 
 
180 aa  51.2  9e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  30.26 
 
 
180 aa  50.8  1e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  26.37 
 
 
194 aa  50.1  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.73 
 
 
316 aa  48.5  5e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.09 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  23.46 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  29.58 
 
 
163 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.22 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.67 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  22.22 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.16 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  23.2 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.2 
 
 
196 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>