More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1396 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 450 aa  878    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  46.83 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  41.15 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.74 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5150  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 520 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  36.05 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  35.19 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  35.19 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 		 440 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  35.44 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  35.19 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  36.19 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  33.73 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  34.43 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.32 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  32.76 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  32.76 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  32.76 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  32.85 
 
 		 430 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  32.93 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  31.99 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  32.26 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  32.58 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  32.52 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  32.52 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  35.11 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  32.48 
 
 		 441 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  32.73 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  33.08 
 
 		 409 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  34.25 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  35.47 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  33.78 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  35.05 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  34.04 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.57 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  33.5 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  32.31 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  31.98 
 
 		 434 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  31.03 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.28 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  31.22 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  33.91 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  30.79 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  34.91 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  30.79 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  29.93 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  31.49 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  30.28 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  33.67 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  30.32 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  29.7 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  28.21 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  31.33 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  30.42 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  30.26 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  30.24 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  31.04 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  30.16 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  30.42 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  29.86 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  32.05 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  29.51 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.65 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  29.89 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  29.89 
 
 		 440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  30.49 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  30.63 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.68 
 
 		 463 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  29.63 
 
 		 440 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  30.56 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.56 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  28.91 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  31.41 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  30.77 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  31.25 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  28.88 
 
 		 463 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  30.65 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  32.7 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  30.09 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  30.63 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682862  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  30.33 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  31.13 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  30.31 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.87 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.87 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.87 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.87 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.87 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  31 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>