131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1385 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  61.38 
 
 
246 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  59.2 
 
 
247 aa  289  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  58.4 
 
 
247 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  62.78 
 
 
254 aa  278  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  57.85 
 
 
251 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.45 
 
 
248 aa  266  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.15 
 
 
250 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  56.33 
 
 
249 aa  253  1e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  59.17 
 
 
235 aa  249  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  58.18 
 
 
234 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  58.19 
 
 
236 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  57.6 
 
 
225 aa  244  7e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  52.19 
 
 
248 aa  241  9e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  55.41 
 
 
246 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.21341e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.65 
 
 
249 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  55.2 
 
 
226 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  55.2 
 
 
226 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  54.66 
 
 
249 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  51.05 
 
 
247 aa  231  7e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.5 
 
 
246 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  53.67 
 
 
225 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.48 
 
 
250 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.73 
 
 
232 aa  224  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.59 
 
 
231 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  58.08 
 
 
235 aa  221  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  55.2 
 
 
224 aa  221  1e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  52.29 
 
 
226 aa  220  2e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  54.55 
 
 
225 aa  220  2e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  52.24 
 
 
245 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  52.24 
 
 
245 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  52.24 
 
 
245 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  52.24 
 
 
245 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  52.24 
 
 
245 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.46 
 
 
226 aa  215  6e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  56.62 
 
 
228 aa  213  2e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  51.82 
 
 
231 aa  213  2e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  51.03 
 
 
229 aa  213  3e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  55.5 
 
 
231 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.12913e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  49 
 
 
235 aa  209  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  53 
 
 
230 aa  208  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  53.57 
 
 
231 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  56.5 
 
 
229 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  51.12 
 
 
225 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  51.6 
 
 
226 aa  205  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  48.15 
 
 
232 aa  200  2e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  52.05 
 
 
225 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  51.6 
 
 
225 aa  197  1e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  51.6 
 
 
225 aa  197  1e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  50.97 
 
 
599 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  47.12 
 
 
221 aa  172  4e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  48.8 
 
 
259 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  33.92 
 
 
321 aa  127  2e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  38.24 
 
 
245 aa  118  8e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  35.41 
 
 
251 aa  117  2e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  37 
 
 
256 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  37.65 
 
 
230 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  35.35 
 
 
225 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.93 
 
 
219 aa  95.9  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.23 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  40 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  33.11 
 
 
325 aa  86.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  30.14 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  37.98 
 
 
226 aa  84.3  2e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  35.16 
 
 
226 aa  82.4  6e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  39.53 
 
 
352 aa  82.4  7e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  36.15 
 
 
239 aa  79.3  6e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  28.84 
 
 
212 aa  79  8e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  39.23 
 
 
330 aa  77.4  2e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.59 
 
 
241 aa  77.4  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  29.03 
 
 
212 aa  77.8  2e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  32.24 
 
 
339 aa  76.6  3e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  3.40042e-06  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.79 
 
 
241 aa  77  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.79 
 
 
241 aa  77  3e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.93 
 
 
216 aa  76.3  4e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.66 
 
 
421 aa  75.5  7e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.56 
 
 
229 aa  73.9  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.93 
 
 
204 aa  73.2  4e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  28.5 
 
 
210 aa  72  8e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.73 
 
 
218 aa  71.2  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.09 
 
 
246 aa  70.9  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.81 
 
 
235 aa  68.9  7e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  27.6 
 
 
213 aa  68.2  1e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.8 
 
 
343 aa  67  3e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.83 
 
 
202 aa  66.6  3e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  27.44 
 
 
218 aa  67  3e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  1.28429e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.95 
 
 
232 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.95 
 
 
232 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.95 
 
 
232 aa  65.1  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  25.49 
 
 
214 aa  64.7  2e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
307 aa  63.9  3e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.58 
 
 
299 aa  63.5  3e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.43 
 
 
233 aa  63.2  4e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.58 
 
 
202 aa  62.8  6e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.59 
 
 
261 aa  62.4  7e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.84 
 
 
306 aa  62  8e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.29 
 
 
213 aa  62  8e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.67 
 
 
328 aa  62  9e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.7 
 
 
242 aa  62  9e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.5 
 
 
233 aa  61.6  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>