195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1382 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  61.58 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  56.94 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.89 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  47.37 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  45.93 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  48.99 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  48.99 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.77 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.5 
 
 		 205 aa  177  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  45.1 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  45.77 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.32 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.38 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.72 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  46.32 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  44.93 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  42.03 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  47.06 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.27 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  41.62 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  41.09 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  44.72 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.3 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  41.41 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.83 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.86 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.69 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.34 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.34 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.34 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  46.86 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  46.86 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  40.58 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.2 
 
 		 451 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  40.4 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.44 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.33 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  39.11 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.11 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.5 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  36.82 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  39.02 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  39.49 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  36.18 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  37.25 
 
 		 534 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.56 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.27 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.83 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.26 
 
 		 469 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.91 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  40.91 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.09 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.38 
 
 		 520 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  38.35 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  38.35 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  42.27 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.11 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  38.73 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  43.22 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  41.75 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  42 
 
 		 499 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  40.41 
 
 		 468 aa  122  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  38.31 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0055  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.61 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  37.44 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  38.78 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  41.84 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  37.24 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  36.92 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  38.16 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  38.16 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  38 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  38.14 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  36.55 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 		 541 aa  117  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  38.27 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  35.05 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.01 
 
 		 472 aa  115  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.23 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  39.78 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  37.76 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  37.37 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  40.22 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  39.78 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  38.66 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  37.04 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  36.73 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4511  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  37.84 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1244  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  35.03 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  36.56 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  36.23 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>