More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1337 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
972 aa  1988    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
924 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
954 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.28 
 
 
933 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  29.76 
 
 
921 aa  379  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  39.24 
 
 
473 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  35.99 
 
 
471 aa  285  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 
470 aa  284  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 
485 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 
485 aa  267  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 
503 aa  267  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 
458 aa  266  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  34.16 
 
 
487 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 
478 aa  260  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
504 aa  259  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.95 
 
 
487 aa  257  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  33.12 
 
 
461 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
485 aa  247  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
472 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 
480 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  33.33 
 
 
489 aa  244  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 
482 aa  243  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.19 
 
 
476 aa  237  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.13 
 
 
481 aa  237  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  34.23 
 
 
504 aa  234  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
483 aa  232  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
487 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 
573 aa  226  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  38.82 
 
 
422 aa  226  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
491 aa  225  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
491 aa  225  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
491 aa  225  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 
484 aa  224  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 
483 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.78 
 
 
491 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.54 
 
 
488 aa  222  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
489 aa  219  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.25 
 
 
491 aa  218  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
493 aa  218  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 
485 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  31.38 
 
 
495 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 
574 aa  214  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  35.82 
 
 
414 aa  214  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 
490 aa  213  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  32.35 
 
 
488 aa  212  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 
490 aa  212  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  32.13 
 
 
491 aa  212  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  32.31 
 
 
578 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 
570 aa  207  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
493 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
480 aa  205  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  36.46 
 
 
422 aa  205  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  32.36 
 
 
489 aa  204  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 
482 aa  202  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
577 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  34.22 
 
 
409 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 
642 aa  199  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  33.92 
 
 
409 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
501 aa  197  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  31.97 
 
 
579 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  36.31 
 
 
426 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  35.83 
 
 
441 aa  197  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
643 aa  196  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  35.43 
 
 
470 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  35.43 
 
 
470 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  35.43 
 
 
470 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  35.43 
 
 
470 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.99 
 
 
547 aa  193  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  38.66 
 
 
469 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  32.39 
 
 
488 aa  191  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  32.83 
 
 
492 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 
610 aa  190  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.09 
 
 
647 aa  188  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.23 
 
 
645 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
490 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  31.28 
 
 
493 aa  185  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  39.62 
 
 
487 aa  185  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.09 
 
 
639 aa  184  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
701 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
636 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 
481 aa  182  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 
503 aa  182  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  31.98 
 
 
399 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 
584 aa  181  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  35.21 
 
 
429 aa  181  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  34.57 
 
 
470 aa  181  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  35.61 
 
 
472 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  31.03 
 
 
489 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
634 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
609 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 
640 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 
586 aa  174  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
645 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  30.6 
 
 
493 aa  172  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  33.83 
 
 
480 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  29.37 
 
 
650 aa  172  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  33.44 
 
 
493 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
636 aa  171  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  38.55 
 
 
439 aa  171  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.77 
 
 
771 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>