More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1318 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  100 
 
 		 443 aa  884    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  52.4 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  40.6 
 
 		 457 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  35.42 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  34.58 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  37.93 
 
 		 448 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  35.48 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  32.4 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 451 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  31.89 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  33.25 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  36.41 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  30.07 
 
 		 477 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  32.48 
 
 		 446 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  29.97 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.71 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.67 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  31.69 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  26.4 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.25 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.25 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.25 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  27.03 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.15 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.25 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  27.25 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.47 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.42 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  33.44 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  26.64 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 478 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 458 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  26.49 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 499 aa  143  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 518 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 457 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 486 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 442 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 525 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.41 
 
 		 554 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 538 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  25.78 
 
 		 503 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 500 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  23.68 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 503 aa  126  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  25.13 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  26.47 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  23.16 
 
 		 521 aa  123  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>