89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1283 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  851    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  61.17 
 
 
411 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  52.17 
 
 
415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  52.04 
 
 
415 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  51.8 
 
 
415 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  51.8 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  51.8 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  52.04 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  51.8 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  51.69 
 
 
415 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  51.8 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  51.32 
 
 
415 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  50.48 
 
 
415 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  49.15 
 
 
413 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  48.43 
 
 
413 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  52.51 
 
 
418 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  47.36 
 
 
417 aa  414  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  52.03 
 
 
418 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  47.45 
 
 
413 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  46.96 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  47.82 
 
 
410 aa  392  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  46 
 
 
413 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  47.2 
 
 
413 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  46.96 
 
 
413 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  46.63 
 
 
415 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  45.72 
 
 
416 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  45.41 
 
 
410 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  46.39 
 
 
413 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  45.74 
 
 
411 aa  358  8e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  43.31 
 
 
404 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  43.31 
 
 
404 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  42.58 
 
 
404 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  44.77 
 
 
411 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  41.36 
 
 
404 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  44.5 
 
 
410 aa  342  5e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  43.73 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  41.99 
 
 
407 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  53.6 
 
 
277 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  38.15 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  36.51 
 
 
420 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  41.12 
 
 
406 aa  265  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  40.63 
 
 
406 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  35.22 
 
 
418 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  35.59 
 
 
419 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  34.95 
 
 
411 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  33.66 
 
 
414 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  32.31 
 
 
436 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  27.06 
 
 
458 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  28.06 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  26.73 
 
 
449 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  26.43 
 
 
449 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  24.62 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  25.51 
 
 
430 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  26.65 
 
 
449 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  24.78 
 
 
447 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  27.44 
 
 
424 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  26.65 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  25.28 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  24.83 
 
 
442 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  25.3 
 
 
436 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  24.61 
 
 
442 aa  106  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  27.55 
 
 
427 aa  106  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  24.2 
 
 
424 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  26.21 
 
 
443 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  22.73 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  21.64 
 
 
450 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  24.67 
 
 
448 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  23.53 
 
 
435 aa  93.2  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  24.59 
 
 
445 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3077  hypothetical protein  44 
 
 
101 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  23.29 
 
 
412 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  23.01 
 
 
424 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  24.2 
 
 
454 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  27.87 
 
 
443 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  23.7 
 
 
439 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  23.86 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  21.88 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  24.46 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  22.86 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  24.22 
 
 
425 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  22.61 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  23.94 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  24.84 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3515  hypothetical protein  24.92 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5444  hypothetical protein  26.8 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  22.45 
 
 
406 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  19.06 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  20.44 
 
 
429 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>