More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1274 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1274  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
594 aa  1233    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000144018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2213  arginyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
588 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4389  arginyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
613 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
577 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
577 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  36.54 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
577 aa  353  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
577 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
581 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
577 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
581 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
581 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
581 aa  350  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
581 aa  350  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
577 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
577 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
577 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
577 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
579 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
577 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
577 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
577 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
581 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
581 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
581 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
581 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
577 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
581 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
579 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
581 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
581 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
577 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
576 aa  340  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
581 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
576 aa  336  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
576 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
579 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
585 aa  334  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
579 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
576 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
576 aa  333  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
577 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
581 aa  331  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
587 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
576 aa  330  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 
582 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
576 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
576 aa  330  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
581 aa  329  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
578 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
587 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
581 aa  326  6e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
578 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
578 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
590 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 
578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
578 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2705  arginyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
598 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 
578 aa  317  4e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3985  arginyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
585 aa  316  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3319  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
575 aa  309  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4156  arginyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.204707  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
576 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
588 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8944  Arginine--tRNA ligase  32.12 
 
 
584 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
571 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
590 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
585 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 
585 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5574  arginyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 
619 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  0.593378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3277  arginyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
570 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431918  normal  0.529534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3956  arginyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
574 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 
582 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
585 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  32.37 
 
 
573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06550  arginyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.386576  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27471  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
603 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_002620  TC0739  arginyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 
563 aa  281  2e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0630  arginyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
593 aa  280  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
566 aa  279  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02051  arginyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
603 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2451  arginyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 
590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
604 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
574 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 
604 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
604 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
602 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2134  arginyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
590 aa  270  5e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0153  arginyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 
572 aa  270  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>