More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1250 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 
208 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33 
 
 
213 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.71 
 
 
207 aa  83.2  3e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 
209 aa  82.4  4e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 
217 aa  81.6  7e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
209 aa  80.9  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.9 
 
 
200 aa  80.1  2e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.9 
 
 
200 aa  80.5  2e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.9 
 
 
200 aa  80.1  2e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
209 aa  79  5e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  36.36 
 
 
198 aa  79  5e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  35.76 
 
 
198 aa  78.2  9e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.01 
 
 
227 aa  77.8  1e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
221 aa  77.4  1e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
237 aa  77.4  1e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
223 aa  77.4  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
200 aa  77.8  1e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
216 aa  77  2e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
256 aa  77  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
591 aa  75.5  6e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
191 aa  75.1  7e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
216 aa  74.3  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
216 aa  74.7  1e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 
224 aa  73.9  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 
220 aa  73.2  2e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
232 aa  73.6  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
201 aa  73.9  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 
223 aa  73.2  3e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
207 aa  73.2  3e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.45 
 
 
220 aa  73.2  3e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
214 aa  72.8  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
210 aa  72.4  4e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
200 aa  72.4  4e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
185 aa  72.4  5e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 
223 aa  72  6e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
221 aa  72  6e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
221 aa  72  6e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
202 aa  71.6  7e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
198 aa  71.2  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 
213 aa  71.2  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
220 aa  71.2  1e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
204 aa  70.9  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
217 aa  70.9  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.08 
 
 
205 aa  70.9  1e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
188 aa  71.2  1e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
207 aa  70.9  1e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 
197 aa  71.2  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.05722e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
213 aa  70.5  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
223 aa  70.1  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
220 aa  70.5  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
226 aa  70.1  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  29.33 
 
 
208 aa  70.5  2e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.35031e-07  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
221 aa  70.5  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
190 aa  70.1  2e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
196 aa  70.5  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 
223 aa  69.7  3e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
201 aa  69.7  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
216 aa  70.1  3e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
241 aa  69.7  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
235 aa  69.7  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
213 aa  69.3  3e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
196 aa  69.3  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
226 aa  68.9  6e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
196 aa  68.9  6e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.74 
 
 
196 aa  68.9  6e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
215 aa  68.6  7e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
215 aa  68.2  8e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
207 aa  68.2  8e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
215 aa  68.2  8e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  29 
 
 
201 aa  67.4  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
199 aa  67.8  1e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 
196 aa  67.8  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 
201 aa  67.4  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
203 aa  67.4  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  33.73 
 
 
211 aa  67  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
214 aa  67.4  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
378 aa  66.6  2e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  29.88 
 
 
206 aa  67.4  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
205 aa  67  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.73 
 
 
220 aa  66.2  3e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 
196 aa  66.6  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  24.41 
 
 
216 aa  66.2  3e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  30.85 
 
 
211 aa  66.2  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
236 aa  66.2  3e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  28.02 
 
 
196 aa  66.2  3e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 
196 aa  66.6  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>