132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1209 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 492 aa  982    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.04 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  26.39 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 494 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 486 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  22.93 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  22.93 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 500 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 500 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 500 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 487 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.32 
 
 		 493 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  20.94 
 
 		 505 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 475 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  22.74 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  20.27 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  20.27 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  20.27 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  20.27 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  20.27 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  21 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.78 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.66 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  19.69 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  19.69 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  20.21 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  23.19 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  19.69 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  19.05 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  19.69 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  19.69 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  19.69 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  19.69 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  20.32 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.01 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  22.4 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.31 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  20.52 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  19.02 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  20.48 
 
 		 487 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.78 
 
 		 477 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  18.43 
 
 		 493 aa  67  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  20.11 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  22.34 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  19.11 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  21.71 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  21.24 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  21.5 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  20.22 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>