More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1204 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
409 aa  835    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  48.79 
 
 
364 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
357 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
396 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
386 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.26 
 
 
366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
388 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  29.16 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.52 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
371 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
418 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
419 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
355 aa  123  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
365 aa  123  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.29 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.29 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
387 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  29.05 
 
 
347 aa  117  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
424 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  25.19 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  26.22 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
425 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
370 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  26.49 
 
 
358 aa  112  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  24.94 
 
 
359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
808 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
360 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
384 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 
890 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
384 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
361 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.8 
 
 
375 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
398 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
390 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
375 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.92 
 
 
350 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  31.11 
 
 
490 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  31.11 
 
 
490 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  25.85 
 
 
358 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
390 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
383 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.56 
 
 
386 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  24.8 
 
 
347 aa  103  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
362 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
375 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
364 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.34 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
386 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.13 
 
 
365 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
386 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
660 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 
373 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
443 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.13 
 
 
365 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
388 aa  99.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
361 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  26.53 
 
 
416 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
370 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
762 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  25.33 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.53 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 
353 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  26.6 
 
 
365 aa  96.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
356 aa  96.3  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
384 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  26.29 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  24.93 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.58 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.58 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
366 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>