31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1198 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  71.63 
 
 
289 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  39.47 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1205  glycosyltransferase  39.41 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  40.07 
 
 
301 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  39.78 
 
 
292 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  38.11 
 
 
296 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5064  hypothetical protein  35.19 
 
 
286 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  33.82 
 
 
282 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  33.71 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3735  hypothetical protein  33.46 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324611  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1480  hypothetical protein  29.26 
 
 
281 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1499  glycosyltransferase  29.1 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  27.88 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  29.64 
 
 
306 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  25.09 
 
 
299 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  27.63 
 
 
260 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29950  hypothetical protein  29.67 
 
 
345 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3013  hypothetical protein  29.95 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4208  hypothetical protein  25.86 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000811212  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0674  hypothetical protein  25.34 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.130919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  27.13 
 
 
563 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2518  hypothetical protein  24.37 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1960  hypothetical protein  25.23 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  25.34 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1407  hypothetical protein  24.37 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2571  hypothetical protein  24.37 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3181  hypothetical protein  24.37 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2133  hypothetical protein  24.37 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2658  hypothetical protein  24.37 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.51 
 
 
619 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>