More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1166 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  65.44 
 
 		 328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  62.69 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 328 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  61.09 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  64.33 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  59.09 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  56.84 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  59.63 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  57.98 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  56.84 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  57.75 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  57.67 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  57.36 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  57.36 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  55.32 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  56.44 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  56.23 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  58.97 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  55.49 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 330 aa  359  4e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 330 aa  359  4e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 328 aa  358  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  52.28 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 329 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  57.06 
 
 		 324 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 		 332 aa  349  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  51.98 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  51.37 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.01 
 
 		 332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 337 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 320 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  51.55 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 327 aa  335  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.55 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  53.03 
 
 		 331 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 333 aa  328  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  51.09 
 
 		 329 aa  325  5e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  49.23 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 		 327 aa  319  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.11 
 
 		 330 aa  318  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  52 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 		 327 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 316 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  47.4 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 319 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 324 aa  311  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  52.32 
 
 		 321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  46.65 
 
 		 351 aa  308  8e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  48.16 
 
 		 323 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  50.93 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.68 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.9 
 
 		 334 aa  305  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  45.26 
 
 		 334 aa  305  8.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.75 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  51.38 
 
 		 321 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.3 
 
 		 337 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  48.02 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  45.97 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  45.65 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>