More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1133 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
359 aa  713  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.91616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  41.03 
 
 
317 aa  226  5e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  6.22557e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
311 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.43 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.43 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.33 
 
 
312 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.11 
 
 
311 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.11 
 
 
311 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.11 
 
 
311 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.11 
 
 
311 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 
310 aa  206  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  42.56 
 
 
322 aa  205  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.11 
 
 
311 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
327 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40 
 
 
331 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.96 
 
 
333 aa  201  1e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  40.14 
 
 
327 aa  201  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  37.78 
 
 
323 aa  201  2e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  41.53 
 
 
336 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.42 
 
 
314 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.41 
 
 
336 aa  198  1e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  39.4 
 
 
315 aa  198  1e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 
322 aa  198  1e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  39.22 
 
 
334 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
310 aa  196  4e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.63 
 
 
342 aa  196  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.48 
 
 
330 aa  195  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.48 
 
 
330 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.48 
 
 
330 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.02 
 
 
350 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  41.36 
 
 
313 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.66 
 
 
341 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.96 
 
 
345 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  40 
 
 
320 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.13624e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 
345 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  36.58 
 
 
345 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  36.58 
 
 
345 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
315 aa  192  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.31 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.66 
 
 
309 aa  190  3e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  37.8 
 
 
333 aa  190  3e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  39.08 
 
 
324 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
309 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 
348 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.18 
 
 
322 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 
347 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
324 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.52 
 
 
306 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 
324 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 
345 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 
313 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 
345 aa  186  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 
314 aa  185  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 
315 aa  184  1e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
341 aa  184  1e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  38.62 
 
 
314 aa  184  2e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
321 aa  184  2e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  38.1 
 
 
331 aa  184  2e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 
318 aa  184  2e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 
354 aa  184  2e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.64 
 
 
349 aa  184  2e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.35 
 
 
322 aa  184  2e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  39.29 
 
 
322 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  41.5 
 
 
325 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.86 
 
 
323 aa  183  4e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.5 
 
 
327 aa  182  5e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.74 
 
 
327 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 
343 aa  182  8e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 
317 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 
317 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
316 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  38.68 
 
 
327 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  40.47 
 
 
319 aa  180  3e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
339 aa  179  5e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
350 aa  179  5e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  38.17 
 
 
348 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 
327 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.58536e-06 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 
332 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
355 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.03 
 
 
328 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  35.44 
 
 
329 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 
341 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.29 
 
 
333 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
331 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  37.91 
 
 
335 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  41.78 
 
 
324 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.94 
 
 
346 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 
324 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  38.98 
 
 
321 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
330 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  39.6 
 
 
321 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  39.6 
 
 
321 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  39.6 
 
 
321 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  34.48 
 
 
330 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 
328 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  39.6 
 
 
321 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>