40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1130 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  29.5 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  26.85 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  26.69 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  24.7 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  24.49 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  25.35 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  24.21 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  26.18 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  22.04 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  22.4 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.04 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.12 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  23.32 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  21.37 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  21.91 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  19.17 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  22.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  23.48 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  24.73 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  21.26 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  24.73 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  26.12 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  23.28 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  21.11 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  21 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  21.32 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  23.42 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  21.72 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  23.86 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  19.8 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  23.56 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  20.6 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.84 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  23.25 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  18.39 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  23.2 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  23.36 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  25.79 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>