More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1095 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1095  signal peptidase I  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.95 
 
 		 187 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  39.1 
 
 		 198 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  36.71 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  39.55 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  39.55 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  38.1 
 
 		 172 aa  88.6  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.25 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  34.09 
 
 		 214 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  34.57 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  34.46 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  35.44 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  40.77 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  40 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.76 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  28.93 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  28.33 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.14 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  39.26 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  34.07 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  30.65 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  32.89 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  33.33 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  31.21 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  27.23 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  31.82 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.85 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  30.06 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  30.06 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  26.56 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  30.06 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  27.93 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  37.5 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  29.63 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  29.63 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  30.06 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  36.84 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  30.48 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.58 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  37.5 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  28.48 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  27.93 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  33.53 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2140  signal peptidase I  33.97 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  30.67 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  29.11 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  33.14 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  31.55 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  32.31 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  31.58 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  28.99 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  31.29 
 
 		 192 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  34.65 
 
 		 170 aa  72  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  28.89 
 
 		 214 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  34.25 
 
 		 197 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  28.72 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.92 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.94 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  31.93 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  26.92 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  25.37 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  27.33 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  31.58 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  32.67 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  26.84 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  30.46 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  31.17 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  35.09 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.41 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  28.44 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  27.96 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  33.33 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.01 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  28.11 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  28.44 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  33.52 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  26.84 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  33.52 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.33 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  34.4 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  27.19 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  27.27 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  28.57 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  26.5 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  27.27 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  34.38 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  32.45 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  29.63 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  29.65 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  29.29 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  29.61 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  27.66 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  32.47 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  38.79 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  32.45 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  33.77 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  33.77 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  33.77 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  33.77 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  33.77 
 
 		 173 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>