33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1052 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  678    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  33.81 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  34.2 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  35.71 
 
 
262 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  31.38 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  31.88 
 
 
258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  31.44 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  32.91 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  34.2 
 
 
258 aa  125  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  35.2 
 
 
260 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  27.54 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  32.26 
 
 
240 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  37.14 
 
 
165 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  29.78 
 
 
235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  30.94 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  34.62 
 
 
239 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  39.33 
 
 
197 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  35.71 
 
 
275 aa  92.8  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  35.71 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  31.58 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  32 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  26.82 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  25.66 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  29.03 
 
 
403 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  29.03 
 
 
406 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  27.86 
 
 
212 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  28.87 
 
 
212 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  32.76 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  32.31 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  38 
 
 
143 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>