More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1008 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  524  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  59.92 
 
 		 254 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  61.11 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  57.94 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  53.6 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2871  TipAS antibiotic-recognition  64.02 
 
 		 170 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  40.48 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  39.68 
 
 		 243 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  40.48 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  39.29 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  39.29 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  39.29 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  39.68 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  39.68 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  39.68 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.65 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  35.32 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32.02 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  33.07 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  34.27 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.57 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.37 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  33.98 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  31.84 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  28.29 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  27.6 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  26.98 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  28.74 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.48 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.29 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  36.09 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  26.24 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  30.15 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  31.27 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  25.81 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  27.6 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  30.52 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  33.16 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  27.96 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  24.3 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  28.46 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  33.33 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  39.51 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  29.8 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  44.78 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  28.16 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  24 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  24 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  47.3 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.2 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>