More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0978 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  700    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  51.37 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  44.31 
 
 		 335 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  44 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  44.01 
 
 		 333 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  44.31 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  44.28 
 
 		 341 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  41.92 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  53.5 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  41.85 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  40.48 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  50 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 261 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  39.38 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 		 276 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  39.44 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  46.91 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  46.28 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  37.99 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  41.18 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 323 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  37.69 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.55 
 
 		 332 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  40 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  43.21 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  36.64 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  34.04 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  37.08 
 
 		 329 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  44.57 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  37.39 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  38.48 
 
 		 329 aa  245  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  34.06 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  36.47 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  41.22 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  39.16 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  41.22 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.84 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  33.53 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  34.83 
 
 		 326 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.78 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  35.58 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  33.23 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  33.53 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  33.14 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  37.54 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  44.06 
 
 		 262 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  32.82 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  35.61 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  41.15 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  35.31 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  33.83 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  38.95 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  31.61 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  31.61 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  36.28 
 
 		 329 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  35.74 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  35.15 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  34.97 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  40.25 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  32.93 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  34.41 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.22 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  33.33 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.6 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.54 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.03 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  35.45 
 
 		 279 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.18 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0722  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.528459  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>