53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0975 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  29.91 
 
 		 444 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.11 
 
 		 342 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  32 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.33 
 
 		 442 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.05 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.81 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  28.02 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  27.73 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.63 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.42 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  28.02 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.02 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.12 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.6 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0687563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.1 
 
 		 479 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.78 
 
 		 460 aa  62  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.5 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.33 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.37 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  21.56 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.89 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.63 
 
 		 456 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2862  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.64 
 
 		 434 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000109572  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  28.99 
 
 		 431 aa  53.5  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.11 
 
 		 423 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 431 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.18 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.26 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2125  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.36 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.145856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.63 
 
 		 545 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.2 
 
 		 443 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.1 
 
 		 446 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 419 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.12 
 
 		 430 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  24.17 
 
 		 553 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  24.17 
 
 		 553 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.8 
 
 		 456 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  24.64 
 
 		 553 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.22 
 
 		 445 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  24.17 
 
 		 553 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.08 
 
 		 470 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 		 622 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  19.44 
 
 		 429 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.92 
 
 		 543 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.72 
 
 		 571 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  23.33 
 
 		 406 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  22.79 
 
 		 533 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.92 
 
 		 275 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  25.96 
 
 		 406 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3042  histidine kinase domain protein  23.89 
 
 		 406 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00679309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>