More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0855 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.56 
 
 
741 aa  711    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  50.85 
 
 
748 aa  736    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  51.96 
 
 
755 aa  770    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.36 
 
 
765 aa  736    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  51.49 
 
 
765 aa  738    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  53.3 
 
 
741 aa  794    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  100 
 
 
755 aa  1548    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  49.34 
 
 
742 aa  735    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  49.34 
 
 
741 aa  736    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  46.6 
 
 
720 aa  612  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  58.16 
 
 
577 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  54.41 
 
 
575 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  51.67 
 
 
586 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.54 
 
 
719 aa  534  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  49.62 
 
 
575 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.37 
 
 
579 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  47.47 
 
 
623 aa  525  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  52.9 
 
 
577 aa  524  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  49.82 
 
 
585 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  49.44 
 
 
584 aa  518  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.41 
 
 
577 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.6 
 
 
577 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  47.65 
 
 
577 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  47.28 
 
 
577 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  46.6 
 
 
577 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  46.9 
 
 
577 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  48.02 
 
 
576 aa  489  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  45.03 
 
 
578 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  45.63 
 
 
575 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.53 
 
 
604 aa  488  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  47.84 
 
 
577 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  47.09 
 
 
577 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  48.88 
 
 
583 aa  485  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  45.76 
 
 
582 aa  486  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  45.97 
 
 
574 aa  481  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  46.79 
 
 
577 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  46.9 
 
 
577 aa  479  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.89 
 
 
654 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.52 
 
 
578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.36 
 
 
587 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  45.76 
 
 
577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  45.85 
 
 
577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  48.11 
 
 
581 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  43.75 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  48.3 
 
 
577 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.47 
 
 
579 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  46.9 
 
 
577 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.51 
 
 
578 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  46.9 
 
 
583 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  44.57 
 
 
595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  44.57 
 
 
595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 
594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  44.57 
 
 
595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  44.65 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  44.28 
 
 
577 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  45.56 
 
 
577 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.03 
 
 
578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  45.06 
 
 
578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  43.1 
 
 
580 aa  449  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 
582 aa  445  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  43.18 
 
 
573 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.34 
 
 
585 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.2 
 
 
583 aa  439  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 
593 aa  436  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  44.28 
 
 
584 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  42.27 
 
 
583 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  41.97 
 
 
577 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  41.23 
 
 
578 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  41.13 
 
 
578 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  40.15 
 
 
577 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  40.15 
 
 
577 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  42.71 
 
 
589 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  40.71 
 
 
584 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  40.71 
 
 
584 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  43.07 
 
 
584 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.71 
 
 
584 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.71 
 
 
584 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
578 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
574 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.06 
 
 
584 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.3 
 
 
584 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.06 
 
 
584 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.11 
 
 
584 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  39.92 
 
 
584 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  38.53 
 
 
579 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  40.3 
 
 
584 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
584 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  39 
 
 
652 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  40.62 
 
 
582 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  37.78 
 
 
594 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  38.09 
 
 
581 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  38.71 
 
 
578 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2430  ABC transporter related  40.22 
 
 
575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_963  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  57.77 
 
 
290 aa  353  5e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0350052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
581 aa  353  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.54 
 
 
580 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.8 
 
 
572 aa  352  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  39.23 
 
 
633 aa  352  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>