More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0739 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  50.5 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  46.88 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  54.64 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  47.92 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  51.55 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  49.49 
 
 		 223 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  52.58 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  47.17 
 
 		 109 aa  106  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.56 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.56 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  50.56 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  43.56 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43.3 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  49.48 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44.12 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  47.96 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  48.31 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  47.52 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.58 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  47.52 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  44 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  46.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  46.53 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  46.88 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  47.96 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.16 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  51.04 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  44.12 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  53.49 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  46 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  48.48 
 
 		 109 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  46.08 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  49.44 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.33 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  46.39 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  45.1 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.33 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  49.48 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  46.88 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.16 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  46.94 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.16 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  38.61 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  45.54 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  42.57 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  45.63 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.33 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  51.16 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  51.16 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  51.16 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  49.47 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  49.5 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  48.42 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  49.48 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  48.42 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  47.42 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  42.57 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  43.43 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  48.39 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  45.54 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  46.32 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  46.32 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  41.18 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  48.39 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  45.26 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  47.87 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  39.81 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  46.67 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  46.88 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  43.14 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  44.55 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  41.24 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  47.83 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  38.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>