More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0737 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  290  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 
129 aa  94.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  41.74 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.37 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.2 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  38.14 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  43.88 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  44.33 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  40.22 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  43.3 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  43.3 
 
 
186 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  34.55 
 
 
170 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  43.3 
 
 
186 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  40.21 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  36.46 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  38.38 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  38.38 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  45 
 
 
288 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.81 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  35.42 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  32.33 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.45 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.84 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.4 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40.24 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39 
 
 
388 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
271 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.27 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  40.2 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.46 
 
 
392 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 
395 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  38 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.79 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  38.38 
 
 
194 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  42.11 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  38.38 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.39 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  36.36 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.84 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.55 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  39.76 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  33.85 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.67 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.36 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.19 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.36 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>