More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0695 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  568  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
322 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  45.55 
 
 
308 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 
313 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
316 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
307 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
333 aa  208  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
321 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
323 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
317 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
333 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
321 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
320 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
318 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
323 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
315 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.23 
 
 
326 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
330 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.2 
 
 
331 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
332 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
304 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.21 
 
 
334 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
324 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
298 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
311 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.87 
 
 
324 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
325 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
322 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
315 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
318 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.64 
 
 
336 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
334 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
339 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
327 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
340 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
316 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
300 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.15 
 
 
327 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
326 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
346 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
330 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
307 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  32.73 
 
 
341 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
339 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
312 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
313 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
335 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  32.99 
 
 
316 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  32.17 
 
 
324 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
332 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  31.43 
 
 
340 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
316 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  33.94 
 
 
331 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
331 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
351 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
350 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
324 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  31.54 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
329 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
326 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
324 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
320 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
292 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
478 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
320 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
319 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
332 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  30.94 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  31.8 
 
 
346 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 
317 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
308 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
327 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
301 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
296 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
328 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 
315 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.63 
 
 
316 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
291 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
313 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
294 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.09 
 
 
294 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
307 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>