More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0660 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  39.84 
 
 		 243 aa  99.4  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  29.95 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  29.95 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  33.55 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  30 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  33.11 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 209 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  28.49 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.41 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.6 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.09 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.5 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  24.78 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  24.4 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.46 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  27.89 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  27.89 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  29.93 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.9 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  22.22 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  27.34 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  27.34 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  34.06 
 
 		 200 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  27.04 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30.56 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.33 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  28.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.38 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>