More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0618 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 265 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  30.8 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  30.8 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 556 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  28.8 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 532 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 539 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 507 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 506 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 507 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 535 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  27.2 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2406  AraC family DNA-binding response regulator  30.12 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 508 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 543 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 548 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 538 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 509 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 365 aa  95.5  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 519 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 529 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  28.89 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 502 aa  92  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  28.52 
 
 		 1316 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 544 aa  88.6  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 414 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 534 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1946  DNA-binding response regulator  24.05 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 525 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 386 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 532 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 523 aa  85.1  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  26.15 
 
 		 1278 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  27.2 
 
 		 1370 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26 
 
 		 1340 aa  82.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 		 1349 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  27.27 
 
 		 1373 aa  82  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  24.55 
 
 		 1324 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0149  two component transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 542 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26 
 
 		 1374 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  23.18 
 
 		 1363 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  27.98 
 
 		 1343 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 519 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  27.19 
 
 		 1400 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 		 472 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 515 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  34.62 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  27.4 
 
 		 1296 aa  77.8  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  28.5 
 
 		 1373 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.98 
 
 		 1298 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25.45 
 
 		 1347 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 773 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.39 
 
 		 1355 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4850  two component transcriptional regulator, AraC family  23.41 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623766 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  31.06 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 548 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  25.3 
 
 		 1378 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 522 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 465 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>