76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0591 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1344    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  47.35 
 
 		 652 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  46.15 
 
 		 640 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  45.71 
 
 		 651 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  45.86 
 
 		 651 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  45.55 
 
 		 651 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  45.55 
 
 		 651 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  45.4 
 
 		 651 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  44.07 
 
 		 656 aa  588  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  44.07 
 
 		 656 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  43.91 
 
 		 659 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  43.91 
 
 		 667 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  45.08 
 
 		 659 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  38.77 
 
 		 742 aa  483  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  40.28 
 
 		 636 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  38.17 
 
 		 640 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  41.48 
 
 		 640 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  39.33 
 
 		 638 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  35.06 
 
 		 679 aa  450  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  40.72 
 
 		 640 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  36.19 
 
 		 648 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  39.76 
 
 		 648 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  35.26 
 
 		 647 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  35.86 
 
 		 617 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.49 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  35.45 
 
 		 620 aa  399  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  36.01 
 
 		 656 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  35.18 
 
 		 655 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  34.72 
 
 		 634 aa  392  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  33.69 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  33.98 
 
 		 634 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  33.28 
 
 		 628 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  33.53 
 
 		 800 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  32.92 
 
 		 647 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  32.83 
 
 		 648 aa  356  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  32.93 
 
 		 629 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  32.99 
 
 		 672 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  44.25 
 
 		 397 aa  345  2e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  32.31 
 
 		 652 aa  331  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  30.93 
 
 		 665 aa  319  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  30.61 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  31.46 
 
 		 673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  30.34 
 
 		 684 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  30.36 
 
 		 643 aa  301  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  33.1 
 
 		 654 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  29.62 
 
 		 633 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  27.66 
 
 		 643 aa  281  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  29.51 
 
 		 643 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  29.5 
 
 		 629 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  30.46 
 
 		 686 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  22.83 
 
 		 602 aa  91.3  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  24.48 
 
 		 1025 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  23.57 
 
 		 765 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  22.92 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  24.72 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.14 
 
 		 795 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  22.79 
 
 		 844 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  24.9 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  24.9 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.8 
 
 		 803 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.09 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  23.08 
 
 		 783 aa  65.1  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  19.76 
 
 		 955 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  20.32 
 
 		 792 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.52 
 
 		 846 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  24.18 
 
 		 632 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  23.67 
 
 		 736 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  21.37 
 
 		 684 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  20.99 
 
 		 711 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  22.37 
 
 		 881 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  24.26 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  20.56 
 
 		 838 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  25 
 
 		 771 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  21.31 
 
 		 596 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  22.31 
 
 		 749 aa  47.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  21.25 
 
 		 663 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>