More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0552 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  860    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 419 aa  411  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 421 aa  358  9e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 416 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 413 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 419 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  40.77 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 426 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  40.45 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 414 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0403  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 442 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>