270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0529 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 464 aa  959    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  29.22 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2834  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4198  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0322  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.11 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.32 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.66 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.98 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.75 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.97 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.75 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.75 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.26 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5820  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.1 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.22 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.2 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.35 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.54 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2265  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000515551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  23.71 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0181  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 595 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000497192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.24 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>