More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0502 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 444 aa  915    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 		 450 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  54.3 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  55.84 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  55.45 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  54.9 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  54.93 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  55.74 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  57.58 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  53.6 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.31 
 
 		 739 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  56.35 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.9 
 
 		 731 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.69 
 
 		 726 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  55.58 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52 
 
 		 735 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 422 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.16 
 
 		 733 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  50.68 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.05 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.29 
 
 		 721 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  50.8 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 440 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  51.49 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  51.03 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  51.88 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  50.66 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.88 
 
 		 734 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.65 
 
 		 734 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.05 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.26 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  49.19 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  47.64 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  49.01 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  46.24 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  49.77 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  49.06 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  50.92 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  51.07 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  46.86 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  45.53 
 
 		 544 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  47.52 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  45.11 
 
 		 519 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  46.52 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  46.45 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.43 
 
 		 443 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  47.72 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  43.69 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  48.39 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  49.19 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  47.04 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  48.73 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  47.04 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  47.04 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  46.73 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  46.64 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  47.47 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  47.44 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  48.02 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  44.93 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  45.04 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  45.24 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  46.46 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  46.68 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  46.68 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  45.06 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  42.53 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  48.51 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  46.28 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>