More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0495 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  100 
 
 		 604 aa  1230    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 580 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 585 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  36.61 
 
 		 603 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  34.96 
 
 		 567 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  37.97 
 
 		 488 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  44.06 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  28.17 
 
 		 597 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  37.01 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  32.95 
 
 		 597 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  34.1 
 
 		 595 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  37.84 
 
 		 604 aa  173  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  32.59 
 
 		 627 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  37.68 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  25.32 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  32.93 
 
 		 569 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 583 aa  160  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  34.13 
 
 		 610 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 578 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  37.31 
 
 		 612 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  30.19 
 
 		 594 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 578 aa  150  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  37.82 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  37.25 
 
 		 600 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  36.12 
 
 		 600 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  37.9 
 
 		 410 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  35.94 
 
 		 587 aa  147  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 576 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  36.74 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35.91 
 
 		 465 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  35.51 
 
 		 574 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  37.9 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  26.63 
 
 		 633 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  36.84 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  36.4 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  33.61 
 
 		 576 aa  138  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  34.28 
 
 		 495 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.95 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  27.49 
 
 		 617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 		 450 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  27.84 
 
 		 600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  29.08 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  30.06 
 
 		 623 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  30.46 
 
 		 594 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.89 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.53 
 
 		 568 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 338 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  34.45 
 
 		 394 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  31.37 
 
 		 599 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  33.91 
 
 		 564 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 398 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 		 393 aa  127  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  36.11 
 
 		 403 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  36.97 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  33.74 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  36.21 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.33 
 
 		 607 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  27.19 
 
 		 596 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  36.82 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  33.33 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 603 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 411 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  36.49 
 
 		 568 aa  124  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 559 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 		 563 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 561 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  35.8 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  35.83 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 366 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  34.07 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  35.83 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.96 
 
 		 568 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>