88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0479 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0479  stage V sporulation protein AC  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1106  SpoVA protein  49.66 
 
 
151 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2282  stage V sporulation protein AC  49.66 
 
 
147 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2731  stage V sporulation protein AC  49.01 
 
 
152 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2304  stage V sporulation protein AC  46.67 
 
 
155 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1222  SpoVA protein  44.52 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000481736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1561  SpoVA protein  47.59 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1248  stage V sporulation protein AC  41.06 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2019  stage V sporulation protein AC  47.33 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3439  stage V sporulation protein AC  44.38 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0122  SpoVA protein  41.43 
 
 
147 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.385931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1376  SpoVA protein  43.95 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3825  stage V sporulation protein AC  45.33 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.460621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07050  Sporulation stage V protein AC  39.04 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4177  SpoVA family protein  45.03 
 
 
152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0136798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1061  SpoVA family protein  45.03 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0415842  normal  0.102128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4289  stage v sporulation protein ac  45.33 
 
 
152 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3809  stage V sporulation protein AC  45.33 
 
 
152 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.403654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4200  SpoVA family protein  45.33 
 
 
152 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000132826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3979  stage V sporulation protein AC  45.33 
 
 
152 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4137  stage V sporulation protein AC  45.33 
 
 
152 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0686624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4089  SpoVA family protein  45.33 
 
 
152 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000123549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1659  stage V sporulation protein AC  39.61 
 
 
155 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.493863  normal  0.375555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1465  SpoVA protein  40.88 
 
 
159 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3898  sporulation stage V protein AC  43.33 
 
 
152 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.373295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0626  spore formation protein spoVAC  40.54 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2767  sporulation stage V protein AC  43.97 
 
 
150 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.428102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4939  sporulation stage V protein AC  40.26 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1743  stage V sporulation protein AC  40.56 
 
 
152 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5249  stage V sporulation protein AC  39.33 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2381  stage V sporulation protein AC  40.67 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5265  SpoVA family protein  39.51 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0227  SpoVA family protein  39.33 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0208  SpoVA family protein  39.33 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5307  SpoVA family protein  39.33 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5375  stage v sporulation protein ac  39.6 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5231  SpoVA family protein  39.6 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4824  stage V sporulation protein AC  39.6 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4839  stage V sporulation protein AC  39.6 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5692  SpoVA family protein  39.6 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4995  stage V sporulation protein AC  39.6 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3688  sporulation stage V protein AC  39.33 
 
 
158 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1654  stage V sporulation protein AC  41.56 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2247  SpoVA protein  42.14 
 
 
145 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0788  stage V sporulation protein AC  38.96 
 
 
159 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0720  stage V sporulation protein AC  34.9 
 
 
157 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0377  SpoVA protein  34.07 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2765  sporulation stage V protein AE  33.63 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.60711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4175  stage V sporulation protein AE  34.51 
 
 
116 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1063  stage V sporulation protein AE  34.51 
 
 
116 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2198  normal  0.21703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07070  Sporulation stage V protein AE  39.77 
 
 
117 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3977  stage V sporulation protein AE  32.74 
 
 
116 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4087  stage V sporulation protein AE  32.74 
 
 
116 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000720162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4198  stage V sporulation protein AE  32.74 
 
 
116 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000578449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3807  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  32.74 
 
 
116 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3823  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  32.74 
 
 
116 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0790  stage V sporulation protein AE  35.79 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3896  sporulation stage V protein AE  33.63 
 
 
116 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.18857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5233  SpoVA family protein  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0206  SpoVA family protein  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1656  stage V sporulation protein AE  33.68 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5267  SpoVA family protein  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5251  stage V sporulation protein AE, truncation  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4997  stage V sporulation protein AE  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4826  stage V sporulation protein AE  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4841  stage V sporulation protein AE  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5377  stage V sporulation protein AE  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3690  sporulation stage V protein AE  35.79 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4941  sporulation stage V protein AE  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5690  SpoVA family protein  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5309  SpoVA family protein  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0229  SpoVA family protein  36.84 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2733  stage V sporulation protein AE  37.8 
 
 
117 aa  54.3  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1563  SpoVA protein  31.48 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.807903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2379  stage V sporulation protein AE  35.79 
 
 
119 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.134026  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1108  SpoVA protein  32.97 
 
 
117 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1463  SpoVA protein  33.68 
 
 
117 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1220  SpoVA protein  34.09 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000192439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3437  stage V sporulation protein AE  31.91 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0722  stage V sporulation protein AE  34.74 
 
 
115 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1246  stage V sporulation protein AE  31.46 
 
 
118 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1741  stage V sporulation protein AE  32.63 
 
 
119 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1657  stage V sporulation protein AE  26.96 
 
 
117 aa  45.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.449041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0124  SpoVA protein  34.52 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00762492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2280  stage V sporulation protein AE  36.99 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2302  stage V sporulation protein AE  28.95 
 
 
121 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2017  stage V sporulation protein AE  28.95 
 
 
121 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1374  SpoVA protein  29.27 
 
 
118 aa  40.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.523405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>