More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0448 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 65 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 65 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  64.06 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  50 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  55.36 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  52.24 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  52.24 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  57.41 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>