87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0430 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  64.66 
 
 
813 aa  1157    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  57.24 
 
 
822 aa  1024    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  54.31 
 
 
827 aa  954    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  51.5 
 
 
815 aa  884    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  64.74 
 
 
811 aa  1147    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  60.64 
 
 
819 aa  1069    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  66.43 
 
 
811 aa  1158    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  41.48 
 
 
784 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  61.85 
 
 
811 aa  1094    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  49.88 
 
 
815 aa  864    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  100 
 
 
831 aa  1727    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  64.66 
 
 
813 aa  1157    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  71.96 
 
 
811 aa  1274    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  56.92 
 
 
822 aa  999    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  62.82 
 
 
811 aa  1116    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  39.62 
 
 
790 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  38.24 
 
 
785 aa  598  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  38.33 
 
 
784 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  35.08 
 
 
823 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  32.78 
 
 
794 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  32.52 
 
 
802 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  32.64 
 
 
802 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  32.98 
 
 
797 aa  469  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  33.14 
 
 
824 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  33.1 
 
 
801 aa  459  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  32.68 
 
 
797 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  33.49 
 
 
796 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  31.74 
 
 
797 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  32.99 
 
 
809 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  31.04 
 
 
829 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  32.23 
 
 
762 aa  432  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  30.81 
 
 
849 aa  429  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  32.41 
 
 
786 aa  425  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  29.22 
 
 
2922 aa  320  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  26.83 
 
 
1303 aa  318  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  27.82 
 
 
2880 aa  309  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  28.79 
 
 
2916 aa  308  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  28.19 
 
 
2887 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  27.29 
 
 
2888 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.59 
 
 
2901 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  27.88 
 
 
3021 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  28 
 
 
2929 aa  302  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.83 
 
 
2732 aa  297  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.83 
 
 
2864 aa  296  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  27.27 
 
 
2860 aa  294  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.87 
 
 
2859 aa  293  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  27.09 
 
 
2845 aa  291  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  25.71 
 
 
2748 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  27.07 
 
 
2823 aa  281  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  26.81 
 
 
2905 aa  280  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  26.08 
 
 
2864 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  27.55 
 
 
2833 aa  277  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  26.29 
 
 
2864 aa  275  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  26.7 
 
 
2932 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  26.25 
 
 
2747 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  26.91 
 
 
2748 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  26.77 
 
 
2842 aa  269  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  26.21 
 
 
2831 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  26.04 
 
 
2875 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  26.1 
 
 
2868 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  26.36 
 
 
2874 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  26.35 
 
 
2758 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  26.14 
 
 
2884 aa  260  6e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  25.88 
 
 
2881 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  26.25 
 
 
2761 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  25.37 
 
 
2870 aa  253  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  24.72 
 
 
2786 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  26.56 
 
 
2769 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  24.88 
 
 
2839 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  26.25 
 
 
2716 aa  241  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  24.6 
 
 
2839 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.55 
 
 
2868 aa  237  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  27.47 
 
 
624 aa  231  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  24.85 
 
 
2793 aa  223  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  24.18 
 
 
2731 aa  222  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  24.78 
 
 
2730 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  24.25 
 
 
2779 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  21.49 
 
 
788 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  21.92 
 
 
802 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  21.75 
 
 
801 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  23.7 
 
 
984 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  29.38 
 
 
2453 aa  87.8  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  21.28 
 
 
900 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  20.57 
 
 
904 aa  57.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  21.91 
 
 
1076 aa  52  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.22 
 
 
1094 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.32 
 
 
1100 aa  47.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>