More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0429 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 447 aa  880    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04600  uracil-xanthine permease  58.65 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0641313  hitchhiker  0.000000425239 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  60.32 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2327  uracil-xanthine permease  59.73 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  49.65 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  49.26 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  48.66 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  48.66 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  46.67 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  49.5 
 
 		 409 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  44.16 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  46 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  45.7 
 
 		 395 aa  332  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1422  uracil-xanthine permease  41.89 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0087754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1232  uracil permease  41.67 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.011581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  40.8 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  40.8 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  43.52 
 
 		 411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  40.44 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  41.8 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  41.63 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  41.63 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  41.63 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  41.63 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  41.49 
 
 		 427 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  41.63 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  41.77 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  41.32 
 
 		 427 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  41.42 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  40.99 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  39.68 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  39.82 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  40.71 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  40.18 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  40.18 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  42.69 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  40.95 
 
 		 414 aa  296  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  40.97 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  40.38 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  40.54 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  42.55 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  43.02 
 
 		 434 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  42.18 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  40.56 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  39.5 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  39.5 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  42.21 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  40.24 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  40.09 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  42.08 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  42.08 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  40.73 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  38.91 
 
 		 424 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  39.36 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  39.49 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  40.05 
 
 		 421 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  42.66 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  39.54 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  41.15 
 
 		 412 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  42.05 
 
 		 434 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  39.9 
 
 		 425 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1784  uracil-xanthine permease  42.5 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000126712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  39.57 
 
 		 441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2501  uracil-xanthine permease  42.27 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000161239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1777  uracil-xanthine permease  42.5 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000163317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  40.05 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1821  uracil-xanthine permease  42.5 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000647194  normal  0.178091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  39.17 
 
 		 416 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  40.6 
 
 		 414 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2879  uracil permease  42.24 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  41.96 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  38.94 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1574  uracil-xanthine permease  41.55 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000671953  normal  0.0882987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1641  uracil-xanthine permease  41.78 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000740931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  40.77 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  40.57 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1649  uracil-xanthine permease  41.55 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  hitchhiker  0.000377571 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  41.77 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1342  uracil permease  42.65 
 
 		 413 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00369344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1689  uracil-xanthine permease  41.78 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000578916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  38.5 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  39.52 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2248  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00954559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  39.18 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1836  uracil-xanthine permease  40.23 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0253304  normal  0.750298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2443  uracil-xanthine permease  42.93 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.161391  normal  0.0740726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  41.97 
 
 		 415 aa  266  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1965  uracil-xanthine permease  42.23 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1641  uracil-xanthine permease  42.45 
 
 		 407 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0997  uracil-xanthine permease  38.81 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  35.79 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  40.62 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  36.84 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  38.76 
 
 		 442 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  36.61 
 
 		 432 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  38.76 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  38.76 
 
 		 442 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  38.53 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  40.36 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  38.55 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>