193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0415 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 455 aa  904    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  42.92 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  43.93 
 
 		 446 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  43.71 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  43.57 
 
 		 447 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  41.19 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  42.79 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  39.56 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  38.85 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  41.52 
 
 		 444 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  40.26 
 
 		 446 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  39.61 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  42.11 
 
 		 450 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  42.25 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  39 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  40.27 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.47 
 
 		 453 aa  299  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  39.42 
 
 		 447 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  38.98 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  38.98 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  38.98 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  38.98 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  38.98 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  38.98 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  37.22 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  38.53 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  38.53 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  38.31 
 
 		 447 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.67 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  36.02 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.92 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  37.96 
 
 		 458 aa  276  8e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  35.98 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  37.75 
 
 		 458 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  36.95 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  37.39 
 
 		 457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  38.91 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  38.59 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  37.62 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  38.11 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  37.86 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  37.62 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  36.13 
 
 		 457 aa  263  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.29 
 
 		 430 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  36.96 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  36.38 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  35.21 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.22 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  36.41 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  34.8 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.17 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  36.97 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  36.6 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.93 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.93 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.42 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  36.47 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  37.05 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  35.31 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  37.86 
 
 		 444 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  35.12 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  34.45 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  36.64 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  36.04 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  34.87 
 
 		 420 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  34.08 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  34.45 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0351  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.71 
 
 		 454 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  34.45 
 
 		 439 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  35.39 
 
 		 458 aa  246  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0953  potassium uptake protein, TrkH family  35.88 
 
 		 442 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  33.85 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  33.85 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  33.85 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  37.15 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  34.22 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  33.63 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  34.16 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  33.33 
 
 		 439 aa  239  8e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  33.41 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  36.16 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  36.96 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  32 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  34.35 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1630  sodium transport family protein  35.95 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  33.92 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.78 
 
 		 616 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  37.2 
 
 		 454 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  37.2 
 
 		 454 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.99 
 
 		 461 aa  229  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.62 
 
 		 633 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1234  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.37 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3973  sodium transporter family protein  32.15 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.61 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.38 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.19 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  35.75 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.12 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  33.56 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  33.85 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>