More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0362 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  68.65 
 
 		 512 aa  739    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  67.12 
 
 		 513 aa  736    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  58.8 
 
 		 518 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  100 
 
 		 517 aa  1068    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  62.28 
 
 		 518 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  58.41 
 
 		 518 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  69.83 
 
 		 518 aa  768    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  69.83 
 
 		 518 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  61.9 
 
 		 518 aa  694    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  58.8 
 
 		 517 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  54.67 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  54.86 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 517 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  55.06 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  54.09 
 
 		 517 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 517 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 		 530 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 514 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  48.35 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  41.59 
 
 		 523 aa  428  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 512 aa  412  1e-113  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  40.23 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  41.06 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  38.49 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  39.45 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  41.44 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  37.7 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  37.82 
 
 		 519 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 		 644 aa  349  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  37.24 
 
 		 644 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 662 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 		 644 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 659 aa  346  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.85 
 
 		 640 aa  346  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 658 aa  345  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 658 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 658 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 		 659 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 641 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  36.22 
 
 		 658 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  36.21 
 
 		 638 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  34.37 
 
 		 636 aa  334  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  34.05 
 
 		 639 aa  329  9e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.85 
 
 		 635 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  37.14 
 
 		 639 aa  327  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  34.3 
 
 		 645 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.17 
 
 		 634 aa  324  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.88 
 
 		 668 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.16 
 
 		 643 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.49 
 
 		 535 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  35.69 
 
 		 646 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.56 
 
 		 636 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.91 
 
 		 545 aa  316  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.33 
 
 		 690 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.46 
 
 		 634 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  33.66 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.72 
 
 		 545 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 643 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  37.69 
 
 		 643 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  33.91 
 
 		 642 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  33.91 
 
 		 642 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  36.63 
 
 		 630 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 		 644 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.98 
 
 		 575 aa  303  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  33.01 
 
 		 664 aa  303  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.01 
 
 		 649 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.07 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.5 
 
 		 548 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.64 
 
 		 638 aa  299  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.3 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.11 
 
 		 548 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 		 632 aa  297  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 		 663 aa  296  8e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  32.69 
 
 		 685 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.69 
 
 		 540 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.18 
 
 		 663 aa  293  6e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.19 
 
 		 649 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  33.65 
 
 		 540 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  34.06 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  32.11 
 
 		 560 aa  291  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.75 
 
 		 540 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  33.86 
 
 		 656 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  33.46 
 
 		 546 aa  289  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  30.91 
 
 		 659 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  33.14 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.04 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>