More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0327 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 628 aa  1303    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  51.29 
 
 		 620 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 620 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  50.24 
 
 		 625 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 615 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  48.24 
 
 		 613 aa  618  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  47.12 
 
 		 624 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  48.53 
 
 		 616 aa  569  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  46.37 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  44.25 
 
 		 613 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.72 
 
 		 614 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  42.3 
 
 		 685 aa  519  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  43.66 
 
 		 653 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  42.47 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.16 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  44.48 
 
 		 610 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.88 
 
 		 622 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 		 593 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  41.41 
 
 		 604 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  43.79 
 
 		 613 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 591 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 		 590 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  41.2 
 
 		 607 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.87 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  43.02 
 
 		 591 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 		 594 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  41.91 
 
 		 594 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  41.91 
 
 		 594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  39.97 
 
 		 669 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  40.78 
 
 		 665 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  41.26 
 
 		 594 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.81 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  42.48 
 
 		 595 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  38.13 
 
 		 601 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  43.4 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  40.17 
 
 		 594 aa  445  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  39.75 
 
 		 658 aa  445  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 593 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 593 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 619 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  38.29 
 
 		 647 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.75 
 
 		 615 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  39.78 
 
 		 629 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.42 
 
 		 613 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  37.98 
 
 		 628 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.49 
 
 		 616 aa  419  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 658 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.23 
 
 		 607 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.8 
 
 		 598 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 		 603 aa  412  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  36.81 
 
 		 617 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  36.81 
 
 		 617 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  36.63 
 
 		 628 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 		 656 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 		 612 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  36.71 
 
 		 666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 		 599 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  35.89 
 
 		 611 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  36.16 
 
 		 613 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 		 613 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  35.97 
 
 		 627 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  35.58 
 
 		 649 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 614 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 624 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 		 610 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  36.17 
 
 		 644 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 638 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 		 617 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  34.66 
 
 		 665 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  35.44 
 
 		 679 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  35.77 
 
 		 708 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  34.8 
 
 		 616 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 692 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  35.68 
 
 		 643 aa  392  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  34.74 
 
 		 671 aa  392  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  38.26 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  36.94 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  36.64 
 
 		 640 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.65 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 646 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>