63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0319 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0319  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2465  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  50 
 
 		 189 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0920  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  48.31 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02576  hypothetical protein  48.31 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2897  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  48.31 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0944  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  48.31 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.346113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02613  predicted anti-terminator regulatory protein  48.31 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3070  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding), glpp  48.31 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1492  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  47.19 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3105  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  48.31 
 
 		 191 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0791634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4023  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  48.31 
 
 		 191 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2908  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  47.75 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2560  glycerol uptake operon antiterminator  42.08 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2877  glycerol uptake operon antiterminator  42.08 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1018  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  38.3 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0933  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  41.94 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1323  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  41.38 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00224266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08130  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  39.57 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0128  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  36.7 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0616  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  38.51 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1388  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  38.15 
 
 		 203 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0602  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  36.57 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4737  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  36.57 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0628  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein, putative  36.57 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0696  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  36.57 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0478  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (G3P_antiterm)  36 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0476  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (G3P_antiterm)  36 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1363  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  41.45 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0479  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  36.57 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0621  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  35.43 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0565  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  35.43 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0534  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  35.43 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2092  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  32.95 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1062  glycerol uptake operon antiterminator  34.05 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0946  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  35.59 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000040322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0865  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  34.1 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0752666  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0883  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  31.61 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1357  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  35.63 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1383  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  35.63 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000112502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0805  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  35.03 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4235  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.9 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000071595  decreased coverage  0.00000000285878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1064  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.9 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000121142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0526  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  34.1 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0936  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1104  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.44575e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0945  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000110817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0958  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000321337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1193  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000179213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1024  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0130  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  29.89 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1123  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  33.33 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2847  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  33.53 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000025966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0280  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  33.9 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1558  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  32.78 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0050  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  30.97 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1358  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  38.07 
 
 		 176 aa  91.7  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000981936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1328  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  36.36 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000936682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1118  GlpP family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2463  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  23.94 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4575  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  24.73 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486402  normal  0.92347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4359  glycerol uptake operon antiterminator  25.68 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2079  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)-like  24.19 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105584  normal  0.435013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5442  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)-like protein  21.51 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>