294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0307 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 514 aa  1045    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  47.68 
 
 		 315 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  45.39 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  42.58 
 
 		 297 aa  133  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  44.52 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  36.88 
 
 		 328 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  36.62 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  39.47 
 
 		 305 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  34.91 
 
 		 297 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  35.66 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  36.96 
 
 		 870 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  34.04 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  32.3 
 
 		 305 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  31.64 
 
 		 301 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  28.64 
 
 		 327 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  32 
 
 		 304 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  32 
 
 		 304 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  33.57 
 
 		 298 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  30.77 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  30.13 
 
 		 305 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  31.94 
 
 		 594 aa  90.5  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  30.99 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  35.48 
 
 		 317 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 		 317 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 		 317 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 		 317 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  36.13 
 
 		 317 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  29.03 
 
 		 1008 aa  87  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  34.84 
 
 		 317 aa  86.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  32.86 
 
 		 438 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  30.99 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  30.77 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  34.84 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  31.51 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  30.63 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  30.63 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  30.63 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  28.17 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  34.84 
 
 		 317 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  31.85 
 
 		 305 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  34.27 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  30.66 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  31.69 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  27.17 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  31.29 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  32.37 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  27.63 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  32.4 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  29.68 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.77 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  31.85 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  30.72 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  30.57 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  27.27 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  29.86 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  29.86 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  31.47 
 
 		 298 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  29.29 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  32.87 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  30.46 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  31.65 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  28.76 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  27.22 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  25.55 
 
 		 292 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  30.5 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.58 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  27.5 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  26.09 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  29.5 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  29.08 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  24.54 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  29.94 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.08 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.45 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  25.48 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  29.17 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  28.66 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  30.38 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  28.91 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  25.1 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  28.91 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  28.17 
 
 		 310 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  29.17 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  29.3 
 
 		 305 aa  66.6  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>