262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0300 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  70.87 
 
 
132 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  70.87 
 
 
132 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  70.87 
 
 
132 aa  183  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  65.87 
 
 
133 aa  183  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  61.42 
 
 
167 aa  169  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  61.42 
 
 
185 aa  165  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  59.06 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  60.8 
 
 
127 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  54.76 
 
 
143 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  65.22 
 
 
116 aa  154  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  57.03 
 
 
151 aa  154  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  54.76 
 
 
142 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  57.03 
 
 
139 aa  152  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  52.85 
 
 
187 aa  150  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  53.97 
 
 
133 aa  146  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  53.97 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  49.59 
 
 
131 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  51.61 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  46.4 
 
 
451 aa  122  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  45.45 
 
 
130 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  43.41 
 
 
447 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  46.4 
 
 
464 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  45.53 
 
 
131 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  46.77 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  46.67 
 
 
130 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.26 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  45.53 
 
 
129 aa  100  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38.4 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4011  transketolase  52.63 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  35 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  30.71 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  31.11 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  33.09 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  34.33 
 
 
185 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  30.22 
 
 
512 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  32.31 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  35.38 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  39.32 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  35.11 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  35.51 
 
 
477 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  33.86 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  35.11 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  35.43 
 
 
495 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  34.11 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  34.62 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  39.13 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  32.26 
 
 
371 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  33.59 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  34.04 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  33.33 
 
 
437 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  33.87 
 
 
472 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4289  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.33 
 
 
476 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  37.89 
 
 
501 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1494  cytidyltransferase-like protein  30.71 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.249918 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0564  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.11 
 
 
476 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0292  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.11 
 
 
476 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2338  rfaE bifunctional protein  31.01 
 
 
173 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0645  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.11 
 
 
476 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  30.09 
 
 
206 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3605  bifunctional ADP-heptose synthase  32.09 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  34.62 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  42.03 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  35.05 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.88 
 
 
481 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2823  rfaE bifunctional protein  31.5 
 
 
200 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  36.63 
 
 
472 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0715  rfaE bifunctional protein  33.08 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.970718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  31.75 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  30.95 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  35.71 
 
 
461 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0342  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30 
 
 
496 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1838  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30 
 
 
475 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.85 
 
 
480 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  33.09 
 
 
488 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  31.65 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  30.95 
 
 
223 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  29.91 
 
 
433 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  37.86 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.34 
 
 
502 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1591  cytidyltransferase-related domain protein  40.85 
 
 
363 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1062  cytidyltransferase-like protein  34.02 
 
 
508 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3361  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.03 
 
 
476 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.211185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.77 
 
 
482 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1184  rfaE bifunctional protein  30 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  30.4 
 
 
149 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1930  cytidyltransferase-related domain protein  33.68 
 
 
226 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.791436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3404  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.58 
 
 
478 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0621  cytidyltransferase-related domain protein  32.41 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3455  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.11 
 
 
476 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.199683 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  32.03 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0769  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.81 
 
 
479 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  38 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  32.32 
 
 
225 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2014  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.82 
 
 
476 aa  50.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000918296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  31.5 
 
 
468 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  30 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  33.33 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  33.59 
 
 
455 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004523  ADP-heptose synthase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  32.09 
 
 
476 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>