More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0254 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  100 
 
 		 308 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.37 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  47.7 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  48.69 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  47.39 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  47.71 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  47.68 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  46.69 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  47.68 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  45.87 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  46.41 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  44.77 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  44.77 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  44.44 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  44.77 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  44.77 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  44.77 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  44.37 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  45.25 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  44.12 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  48.12 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  46.31 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 396 aa  262  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  44.22 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  48.12 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  44.41 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  43.79 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  44.74 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  42.9 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  44.08 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  43.93 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  44.05 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  44.05 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  45.51 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  43.71 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  46.03 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.44 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.42 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  46.33 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  42.31 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.81 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  42.53 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  43.28 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  48.83 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  43.75 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  40.92 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  43.23 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  43.13 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  41.99 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  44.3 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  46.84 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  40.07 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  46.64 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.16 
 
 		 556 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  42.05 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  40.53 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  42.48 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.18 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  41.75 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  40.2 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  42.35 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  41.82 
 
 		 316 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  41.38 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  41.38 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  41.83 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  42.31 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  45.07 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  42.58 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  46.38 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  41.48 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  41.27 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>