100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0213 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0213  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  427  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000585453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.04 
 
 
185 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.9 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.2 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.66 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  27.55 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.3 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.59 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.56 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.19 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.55 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  30.16 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.44 
 
 
368 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.29 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.7 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  29.84 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  27.59 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  37.5 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.64 
 
 
259 aa  61.6  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.04 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  25.73 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.32 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.04 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0389  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.21 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.59 
 
 
190 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.53 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.33 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.79 
 
 
211 aa  58.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  26.89 
 
 
220 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  36.45 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  27.62 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.72 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.57 
 
 
580 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.12 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  26.07 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.47 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  27.36 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.93 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  34.15 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.88 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.13 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.26 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.17 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.26 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.94 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  26.29 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  30.26 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  22.39 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  27.89 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  24.87 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  28.12 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.23 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  27.68 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.89 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1573  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.56 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0159916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  27.98 
 
 
185 aa  48.5  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  29.13 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  27.64 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25 
 
 
222 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.37 
 
 
216 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  33.04 
 
 
210 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0612  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.97 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.67 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  32.11 
 
 
406 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  29.2 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.5 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  30.39 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  26 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.23 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.93 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  27.14 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  26.13 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  27.46 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.51 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  25.38 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  25.71 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0098  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  30.38 
 
 
287 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  27.93 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  27.93 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  29.73 
 
 
267 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0388168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  27.86 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.44 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  27.69 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  28.93 
 
 
310 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  26.42 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  28.32 
 
 
208 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  26.98 
 
 
209 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.99 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  25.5 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.99 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  25.5 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002709  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  29.41 
 
 
256 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  25.5 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.42 
 
 
233 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00747  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.44 
 
 
254 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1959  hypothetical protein  26.47 
 
 
205 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>