30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0210 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0210  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  100 
 
 
96 aa  196  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2618  stage III sporulation protein D, SpoIIID  74.67 
 
 
87 aa  119  1e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0585325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2156  stage III sporulation protein D  65.33 
 
 
83 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2446  stage III sporulation protein D  65.33 
 
 
83 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17740  Sporulation stage III transcriptional regulator SpoIIID  62.67 
 
 
86 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2375  stage III sporulation protein D  62.67 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0086  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  60 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0108  regulatory protein, DeoR  64 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0325282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5521  stage III sporulation protein D  56.41 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4975  stage III sporulation protein D  56.41 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0186046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4963  stage III sporulation protein D  56.41 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.87524e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5129  stage III sporulation protein D  56.41 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0462808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5078  sporulation stage III transcriptional regulator SpoIIID  56.41 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00244653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5405  stage III sporulation protein D  56.41 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00910666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3799  sporulation stage III transcriptional regulator SpoIIID  56.41 
 
 
132 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939872  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2134  regulatory protein, DeoR  58.23 
 
 
83 aa  94  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2836  transcriptional regulator  57.33 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2372  transcription regulator of sigma-E/sigma-K-dependent gene spoIIID  58.67 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2750  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  53.66 
 
 
106 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4764  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  58.67 
 
 
82 aa  90.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.76529e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4159  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  54.67 
 
 
83 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.158852  normal  0.0248911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3395  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  55.41 
 
 
87 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3283  sporulation transcriptional regulator SpoIIID  55.41 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3145  regulatory protein, DeoR  54.67 
 
 
83 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0646  hypothetical protein  52.56 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.80732e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2469  hypothetical protein  51.28 
 
 
84 aa  79.7  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.87642e-07 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5370  stage III sporulation protein D  61.4 
 
 
68 aa  77  8e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.426705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5549  stage III sporulation protein D  61.4 
 
 
68 aa  77  8e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.7747e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5401  stage III sporulation protein D  61.4 
 
 
68 aa  77  8e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000102356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5456  stage III sporulation protein D  61.4 
 
 
68 aa  77  8e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.9459e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>