More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0196 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.64 
 
 		 224 aa  265  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.34 
 
 		 226 aa  257  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.05 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  44.34 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  44.75 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  45.09 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  41.29 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  41.29 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  42.01 
 
 		 222 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  42.04 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  42.08 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.71 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.75 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  37.95 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  42.53 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  38.67 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.58 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.27 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.01 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.99 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  39.82 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  40 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  43.42 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  41.82 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  41.89 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.83 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  40.91 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  39.64 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>