More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0192 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  100 
 
 		 597 aa  1208    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  28.45 
 
 		 660 aa  201  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.69 
 
 		 664 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.03 
 
 		 662 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  29.26 
 
 		 643 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  28.43 
 
 		 664 aa  187  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  27.9 
 
 		 653 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  34.15 
 
 		 654 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  37.46 
 
 		 648 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  37.46 
 
 		 648 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  37.16 
 
 		 654 aa  177  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.43 
 
 		 648 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  41.1 
 
 		 293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  42.57 
 
 		 667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  42.57 
 
 		 667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  34.01 
 
 		 644 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.35 
 
 		 950 aa  173  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 239 aa  173  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  42.73 
 
 		 1090 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  34.21 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  40.27 
 
 		 779 aa  172  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  42.2 
 
 		 233 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  39.37 
 
 		 1130 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.75 
 
 		 919 aa  171  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  34.4 
 
 		 650 aa  171  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 		 234 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  41.58 
 
 		 682 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  36.74 
 
 		 885 aa  170  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0193  ABC transporter related  27.04 
 
 		 647 aa  170  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.13 
 
 		 649 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.36 
 
 		 251 aa  169  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  39.55 
 
 		 228 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  42.2 
 
 		 233 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.88 
 
 		 656 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.83 
 
 		 649 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  43.81 
 
 		 234 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.64 
 
 		 888 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  32.53 
 
 		 655 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  41.09 
 
 		 656 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  40.2 
 
 		 668 aa  168  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.82 
 
 		 647 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  38.94 
 
 		 687 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  39.73 
 
 		 238 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  43.39 
 
 		 682 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  38.94 
 
 		 681 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  38.94 
 
 		 681 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  36 
 
 		 652 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 228 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 243 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 233 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 238 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  26.19 
 
 		 671 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  39.82 
 
 		 653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  38.46 
 
 		 258 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 		 646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  32.86 
 
 		 647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39.91 
 
 		 233 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 		 221 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  38.94 
 
 		 306 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  40.18 
 
 		 231 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.15 
 
 		 229 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 279 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  33.44 
 
 		 650 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  39.63 
 
 		 678 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  39.63 
 
 		 678 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.63 
 
 		 678 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 233 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 230 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 234 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  38.79 
 
 		 903 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 240 aa  164  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.91 
 
 		 242 aa  164  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.93 
 
 		 233 aa  164  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.27 
 
 		 646 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 277 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  37.93 
 
 		 231 aa  163  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.16 
 
 		 239 aa  163  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 247 aa  163  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  38.46 
 
 		 229 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.82 
 
 		 661 aa  163  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  24.29 
 
 		 652 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  41.59 
 
 		 243 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  40.27 
 
 		 230 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  39.73 
 
 		 237 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 237 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 		 230 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  39.82 
 
 		 224 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  37.33 
 
 		 253 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  38.01 
 
 		 272 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  39.35 
 
 		 225 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 237 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 256 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  40.18 
 
 		 239 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  40.27 
 
 		 232 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  41.38 
 
 		 218 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.81 
 
 		 232 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 244 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  36.53 
 
 		 224 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>