More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0140 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.69861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.38 
 
 
176 aa  211  5e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
179 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
180 aa  208  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.63 
 
 
186 aa  207  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.88 
 
 
181 aa  206  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
183 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
183 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
180 aa  205  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
176 aa  203  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.9 
 
 
177 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.28 
 
 
180 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.17 
 
 
180 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.54 
 
 
181 aa  199  1e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.68 
 
 
186 aa  200  1e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
174 aa  200  1e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  199  2e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
177 aa  199  2e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  199  2e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.4 
 
 
190 aa  199  2e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  198  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.57 
 
 
181 aa  198  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.58 
 
 
180 aa  197  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
176 aa  197  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  197  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  197  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  197  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  197  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  197  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
179 aa  197  8e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
180 aa  197  8e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
177 aa  195  2e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
189 aa  195  2e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.48 
 
 
178 aa  195  2e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.36 
 
 
181 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.02 
 
 
176 aa  194  4e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
176 aa  194  4e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 
182 aa  194  4e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  194  5e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  194  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
180 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  193  8e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  193  8e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  193  8e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  53.49 
 
 
176 aa  193  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56 
 
 
189 aa  192  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
190 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
175 aa  191  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 
176 aa  191  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.76 
 
 
175 aa  191  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
179 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
178 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
175 aa  190  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
175 aa  190  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
175 aa  190  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
175 aa  190  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
183 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
183 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
184 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
175 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
175 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
175 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
181 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
178 aa  188  3e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
176 aa  188  3e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00124544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
176 aa  188  3e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  188  3e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.29 
 
 
181 aa  188  3e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
182 aa  188  3e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
182 aa  188  3e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
178 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
177 aa  188  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
176 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
181 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
181 aa  187  6e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
169 aa  187  6e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
176 aa  187  6e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
181 aa  187  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
181 aa  187  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
178 aa  187  9e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
175 aa  186  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
176 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.14 
 
 
179 aa  185  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.43113e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2046  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
184 aa  185  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
187 aa  184  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>