95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0127 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0127  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000412675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2491  stage V sprulation protein T  61.2 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2805  stage V sprulation protein T  61.2 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2655  AbrB family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3088  transcriptional regulator, AbrB family  58.7 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000437828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0183  transcriptional regulator, AbrB family  61.54 
 
 		 180 aa  220  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0595  AbrB family transcriptional regulator  62.09 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0113  AbrB family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0083  AbrB family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0165891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0216  transcriptional regulator, AbrB family  59.68 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.643498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0073  AbrB family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0133  transcriptional regulator, AbrB family  58.6 
 
 		 180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000474992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0080  AbrB family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0068  transcriptional regulator, AbrB family  56.52 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2071  transcriptional regulator, AbrB family  56.04 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1006  transcriptional regulator, AbrB family  53.01 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000308031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0049  transcriptional regulator, AbrB family  57.69 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21190  transcriptional regulator, AbrB family  54.55 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.609479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0049  AbrB family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0051  transcriptional regulator, AbrB family  56.91 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0063  stage V sporulation protein T  52.49 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0059  stage V sporulation protein T  52.49 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0052  stage V sporulation protein T  52.49 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0053  stage V sporulation protein T  51.93 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0060  stage V sporulation protein T  51.93 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0049  stage V sporulation protein T  51.93 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0049  AbrB family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0053  stage V sporulation protein T  51.93 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0049  stage V sporulation protein T  51.93 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5257  stage V sporulation protein T  51.93 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1244  transcriptional regulator, AbrB family  42.78 
 
 		 172 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.35967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06360  transcriptional regulator, AbrB family  59.7 
 
 		 86 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3130  transcriptional regulator, AbrB family  72.55 
 
 		 80 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2116  transcriptional regulator, AbrB family  70.59 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05890  transcriptional regulator, AbrB family  68.63 
 
 		 80 aa  72  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3909  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 85 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0105  transcriptional regulator, AbrB family  52 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000445761  unclonable  0.000000000174996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0040  AbrB family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0507223  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0059  transition state regulatory protein AbrB  60.38 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0251658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0064  AbrB family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000448918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0032  AbrB family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5274  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0035  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0032  AbrB family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0065  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.25498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0033  transition state transcriptional regulatory protein  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0046  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0042  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0033  transition state transcriptional regulatory protein  68.63 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0493749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0036  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0034  transition state transcriptional regulatory protein AbrB  68.63 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0268  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000426571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0277  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000039637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0164  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000069654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0062  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0030  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3312  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 81 aa  67  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.101256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3070  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 81 aa  67  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0032  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 99 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0047  AbrB family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 85 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000190016  hitchhiker  0.0000032494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0047  transcription regulator AbrB  60.78 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000208345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0127  transcriptional regulator, AbrB family  57.75 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000836565  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0194  transition state regulatory protein AbrB  63.27 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0042  transcriptional regulator, AbrB family  62.75 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1828  transition state regulatory protein, abrB  34.23 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2000  transition state transcriptional regulatory protein  34.23 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1812  transition state regulatory protein  34.23 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.950306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2077  transition state transcriptional regulatory protein, putative  34.23 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1858  transition state transcriptional regulatory protein  34.23 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2097  putative transition state transcriptional regulatory protein  34.55 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000136428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2100  AbrB family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000145229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0173  transcriptional regulator, AbrB family  60.78 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000901689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2034  putative transition state transcriptional regulatory protein  39.76 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4093800000000004e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1863  AbrB family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0995656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1839  AbrB family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0045089  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0235  transition state regulatory protein, AbrB  59.18 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0146221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2936  transcriptional regulator, AbrB family  58.82 
 
 		 84 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000614981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0021  transition state regulatory protein  59.18 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3307  putative transition state transcriptional regulatory protein  56.86 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2002  putative transition state transcriptional regulatory protein  56.86 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0187  transition state regulatory protein AbrB  57.14 
 
 		 92 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000321307  hitchhiker  2.32472e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2375  transition state regulatory protein AbrB  60 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.371411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2992  AbrB family transcriptional regulator  58 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.828454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2883  transition state regulatory protein AbrB  57.69 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2217  transition state regulatory protein AbrB  55.1 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2453  transition state regulatory protein AbrB  57.69 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2724  transition state regulatory protein AbrB  56.25 
 
 		 92 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00162837  hitchhiker  0.00326326 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1724  transition state regulatory protein  49.06 
 
 		 93 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2600  transition state regulatory protein AbrB  53.06 
 
 		 92 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0487  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 83 aa  51.6  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00969946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0618  transcriptional regulator, AbrB family  38.03 
 
 		 83 aa  50.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000296518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1204  transcriptional regulator, AbrB family  39.71 
 
 		 82 aa  50.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000054071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0598  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 82 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3032  transcriptional regulator, AbrB family  46 
 
 		 90 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>